L'ingénierie sanitaire désigne l'ensemble des méthodes, des outils et des dispositifs mobilisés pour garantir la sécurité sanitaire de l'eau destinée à la consommation humaine. Elle articule des disciplines scientifiques (microbiologie, chimie, toxicologie), une expertise technique (traitement, analyse, surveillance) et un cadre réglementaire (code de la santé publique, directives européennes).
Ce champ couvre la conception et l'exploitation des filières de traitement, la définition des paramètres de surveillance, l'organisation des campagnes d'analyses, les plans de gestion de la sécurité sanitaire, l'interprétation des résultats au regard des valeurs de référence et la réponse en cas d'alerte. En France, il est coordonné par les Agences régionales de santé, en lien avec les collectivités, les laboratoires agréés et les exploitants. L'ingénierie sanitaire repose sur une gestion probabiliste du risque : on ne garantit pas une absence totale de contaminants, mais un niveau de risque considéré comme acceptable. Ce choix soulève des questions politiques, en particulier face aux incertitudes (exposition chronique à faible dose, effets cocktail, substances émergentes). Plusieurs voix scientifiques et associatives critiquent son caractère techniciste et cloisonné et appellent à une conduite plus ouverte, associant les habitantes, les habitants et les savoirs situés, dans la logique d'une démocratie de l'eau.
